脚本:元基因组管道和实验室中使用的其他常规脚本 源码

密歇根州地球微生物实验室 欢迎来到GitHub Repo,获取实验室中使用的一些通用NGS,数据分析和挖掘脚本。 一些脚本实现了我们的简短QC,汇编,合并等流水线,并依赖于许多第三方软件的存在。 其余的是Bash脚本或核心或 。 这意味着,如果您安装了Perl或Python 3,则使用这些脚本不需要任何其他操作。 由于实验室正在积极使用这些脚本,因此可以期待对任何全面支持。 如果您发现任何错误或更轻松/更快速/更优雅的解决方案,请告知我们。 语言和操作系统依赖性 这些脚本应与Linux和其他类似unix的环境的多种版本一起使用。 这是您需要的易于安装的语言列表: Perl版本5.10 +