Aflav_thesis_supp 源码

黄颈鼠姬鼠的生态和种群遗传学。 该知识库包含以上标题论文的补充材料。 其中包括以下内容: 第2章 代码 denovo_map_parameter_optimisation.sh使用Stacks 2.3d的denovo_map.pl管道优化参数以对样本进行基因分型。 stacks_data_extraction.sh从Stacks 2.3d中提取相关指标以优化参数 denovo_pipeline.sh在优化的参数组合上运行denovo_map.pl,并准备用于谱系构建的数据 M.musculus_insilico_digestion_parallel_SbfI_MseI.R运行参考基因组的计算机限制性内切酶消化并输出各种图 M.musculus_insilico_digestion_parallel_SbfI_MseI.R运行参考基因组的计算机限制性内切酶消化并输出各种图 table