bioruby polymarker:PolyMarker的Web界面 源码

PolyMarker 这是一个便于使用PolyMarker的服务器。 系统依赖 该服务器是使用rails 5.1上的ruby 2.4开发的。 其他版本也可以使用,但未经测试。 PolyMarker已在MacOS X和Linux(Ubuntu)上进行了测试。 PolyMarker使用sidekiq排队,这也取决于redis 。 您需要安装ncbi-blast 。 设置服务器。 首先要做的是加载不同的引用 rake reference:add[references.yml] 该文件的格式为yaml 。 它可以包含具有以下字段的多个引用: 名字。 将在服务器中显示的名称 路径。 带有参考的未压缩fasta文件的完整路径。 辉光和爆炸指数将在该路径上生成。 基因组计数。 参考文献中的基因组数量:四倍体为1,四倍体为2,等等。 arm_description在polymarker中用于