TaxOnTree:用于在系统发生树中关联分类信息的程序 开源

TaxOnTree是一个系统发育程序,用于将系统发育树中的分类信息相关联。 输出是配置为在FigTree中打开的NEX格式树文件,用户可以通过任何分类单元或与查询序列共享的祖先来Swift着色。 输入可以是要在BLAST搜索中使用的Fasta格式的文件,也可以是由其标识符(UniProtAC或NCBI gi)表示的序列列表(如果已有集群)。 同样,由用户软件和特定设置产生的newick文件可用于进行分类标记。 TaxOnTree将其用户转变为分类学专家。 TaxOnTree还纠正了NCBI分类标准中缺少某些分类单元的问题。 命令行程序易于设置,可以与多种生物信息学工具结合使用,以PDF格式生成彩色树。 http://biodados.icb.ufmg.br/taxontree中的TaxOnTree可作为Web工具用于低要求的工作。