JAST:Java组装和脚手架工具

JAST（Java Assembling and Scaffolding Tool）是一个用于从成对的Illumina文件执行组装和脚手架的程序。它使用以下软件：弹性条、A5、领结、天鹅绒优化器。请参阅它们的许可协议以获取更多详细信息，并在使用JAST之前检查它们都已安装在您的计算机上。JAST的主要目的是管理几个软件之间的中间步骤。JAST需要所有步骤的配置文件（A5管道除外）。这些文件包含您要用于上述软件的选项。每个选项必须由换行符分隔。一些选项被禁止，因为它们已经被JAST使用。要了解如何使用JAST，请使用“-h”或“--help”选项。例如：java -jar jast.jar -h。JAST使用2014年6月下载的JSA。