认定蛋白质交互网中的功能模块对于理解细胞的组织结构,处理过程及其功能都是至关重要的。由于一个蛋白质可能具有多重功能因此蛋白质功能模块可能会相互交叠。然而,目前已有的一些识别功能模块的软聚类算法有如下两
获取真核细胞中细胞核内蛋白质定位的信息对注解蛋白质功能具有非常重要的意义。针对于利用计算方法预测蛋白质在亚核水平上的定位更具挑战性的问题,提出了基于自互协方差变换与递归特征消除预测蛋白质亚核定位的方法
首先构造结构域的距离矩阵灰度图像; 其次建立典型二级结构的距离函数, 并分析所呈现的灰度模式; 然后基于模板匹配和塔式分解, 提出了结构域特征; 最后在结构类和折叠子两个层次实施结构域分类。本方法在第
一篇关于蛋白质组的综述! Bioinformatics tools for proteomics, also called proteome informatics tools, span today
定量生物学中最复杂的问题之一是如何管理噪声源以及对细胞功能的后续后果。 遗传网络中的噪声是不可避免的,因为化学反应是概率性的,并且通常每个细胞中存在的基因,mRNA和蛋白质的数量不定。 以前的研究集中
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传统机器学习方法在蛋白质关联图预测中要求满足独立一致性的条件,为了克服传统机器学习独立一致性假设,并且利用关联残基之间的规则约束,提出一种基于扩展的Markov逻辑网的蛋白质beta关联预测方法,该方
蛋白质分子量分解问题数学模型及求解,孙浩,史团委,针对分子量分解问题,本文建立了一般的元一次线性方程通用模型,设计了在拥有或不拥有计算机两种不同情况下的算法,分别为“动�
基于比较蛋白质组学筛选嗜酸氧化亚铁硫杆菌硫氧化相关蛋白质,彭安安,夏金兰,在基于热水浴-TritonX-114相分离特化空间蛋白质的基础上,基于比较蛋白质组学方法和生物信息学分析,对在Acidithi
DomFun DomFun是使用系统方法将功能分配给未知蛋白质的新系统,而无需考虑其序列但其功能域与功能系统相关联。 它使用在蛋白质结构域和功能注释之间计算的关联作为训练数据集,并通过查找蛋白质的结构