CMARRT_python:用于峰值调用的CMARRT算法的Python实现 源码
CMARRT算法的Python实现 该算法最初是为分析ChIP芯片数据而开发的: Kuan PF,Chun H,Keles S. CMARRT:一种通过整合相关结构来分析切片阵列中ChIP芯片数据的工具。 Pac Symp生物计算。 2008; 515–526。 在这里,我已经将该算法修改为可用于任何连续数据向量(即log2(提取/输入)ChIP-seq数据)。 该算法目前一次只能处理一个染色体的数据。 用法和参数摘要 usage: run_cmarrt.py [-h] [-p P] [-o O] [-q Q] [-s S] [--resoluti
文件列表
CMARRT_python-master.zip
(预估有个8文件)
CMARRT_python-master
.gitignore
23B
peak.py
3KB
run_cmarrt.py
6KB
LICENSE
1KB
README.md
3KB
run_cmarrt_bigwig.py
5KB
bedgraph.py
4KB
cmarrt.py
20KB
用户评论