水下滑翔机是一种依靠重心和自身净浮力变化驱动航行的新型水下机器人。为满足其长时间大尺度海洋调查的要求，设计了一种无线电和铱星卫星通信相结合的通信系统，并根据通信系统在海洋环境下通信链路不稳定的特点，设计了一种改进Xmodem通信协议，以保证水下滑翔机在海洋调查过程中通信的有效性和可靠性。通过海上实验表明：该通信系统和改进Xmodem协议可以满足水下滑翔机上传实验数据的应用需求。