运行Simulink模型的仿真模式主要有两种：Simulink模型窗口运行模式和MATLAB命令窗口仿真模式。这两种方法的区别类似于Windows操作系统和Dos操作系统的区别，前者直接在Simulink窗口通过鼠标进行操作，后者在MATLAB命令窗口通过命令的形式对模型进行仿真。前者比后者直观，后者比前者容易进行批处理。