VMD蛋白质结构软件教程

用于机器学习蛋白质结构的标准化数据集

凋亡蛋白质是一种有着特殊功能的蛋白质,在生物体的生长和维持体内平衡中扮演着重要的角色.在细胞凋亡过程中抗与促凋亡蛋白质对细胞凋亡的调控起着不同的作用.如果抗凋亡蛋白质或者促凋亡蛋白质失活,将导致癌症和

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蛋白质侧链预测 使用循环信念传播对蛋白质结构的马尔可夫随机场表示法预测蛋白质侧链构象

Purα蛋白质调控p53蛋白乙酰化的研究，吴怡，章小斌，蛋白质翻译后修饰包括有甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化等。这些修饰可改变染色体的状态，影响转录因子与DNA序列的结合，能对基因

本文介绍蛋白质软件的安装方法，包括并行环境openmpi、relion GPU版、coot、pymol、Gautomatch、Gctf、frealign、bsoft、ctffind、DoGpicker

STITCH 4.0是一款用于研究化合物与蛋白质相互作用的软件工具，它可以帮助用户分析化合物对蛋白质结构和功能的调控作用，从而揭示它们之间的相互作用机制。该软件使用了多种基于启发式算法和结构预测技术的

针对蛋白质二级结构机器学习预测方法，忽略氨基酸疏水性特征以及氨基酸之间的长程作用和准确率不高的现状，进行了比较实验分析。采用氨基酸对应的疏水能值替换蛋白质中相应的氨基酸，得到疏水能值的序列。实验结果表

基于经验模态分解（EMD）和神经网络，提出了一种短时交通流量预测方法。通过EMD分解把交通流量分解成不同的模态，利用神经网络对分解后的各分量进行预测，再将预测值累加得到最终的预测结果。利用EMD与神经

将模拟退火(SA）思想用于求解蛋白质结构预测问题，并在此基础上提出了两个提高解的质量和加快收敛速度的改进策略，计算结果表明改进后的SA算法的计算效率优于目前常用的遗传算法和Monte Carlo方法。