电子商务系统的总体设计是系统设计的一个重要部分，是在系统规划的体系结构的基础上，针对企业电子商务目标，界定系统的外部边界和接口，刻画系统的内部组成及其相互关系，描述系统的处理过程，确定未来电子商务系统的逻辑结构。 信息系统设计主要按从上至下的顺序，首先设计系统的总体结构，然后再逐层深入，直至进行每一个子系统和模块的详细设计。其中，总体设计是指在系统分析的基础上，对整个系统的结构、功能划分（子系统及模块）、系统软硬件环境（包括系统运行的软件环境架构、硬件设备）的配置、系统接口及集成和部署方案等方面进行合理安排。详细设计则是在总体设计的基础上，对各子系统及模块的输入、输出、处理和数据存储等内容进一步细化，使其能直接指导后续的系统开发工作。