delphyne template:未来OHDSI ETL项目的精选模板 源码
OHDSI ETL包装器的模板 用于将来的OHDSI项目的ETL模板。 提供实现 Python软件包功能的标准存储库结构。 注意:此模板仅在PostgreSQL中进行了测试。 入门 去做 仓库概述 /root main.py触发ETL执行。 需要最少的自定义,例如默认连接参数和管道版本信息。 README-sample.md为项目提供了基本的README文件,包括有关如何运行ETL的说明。 完成初始ETL设置后,可使用它代替本自述文件。 requirements.txt应包含特定于项目的ETL依赖关系。 强烈建议将软件包固定到特定版本。 delphyne是强制性依赖项,默认情况下始终包括在内。 /config ETL配置文件夹,包含: config-sample.yml ,常规管道配置选项。 复制并重命名此文件以创建不同管道执行方案所需的尽可能多的配置。 source_con
文件列表
delphyne-template-master.zip
(预估有个46文件)
delphyne-template-master
README-sample.md
588B
src
test
R
run_create_tests.R
1KB
custom_tables
TreatmentLine.R
7KB
run_evaluate_tests.R
1KB
config-sample.yml
507B
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