根据主动控制思想和Lyapunov稳定性定理，构造主动控制器使得两个异结构的混沌系统在短时间内实现同步，并证明了混沌同步的鲁棒稳定性；利用MATLAB的Simulink技术进行数字仿真，将同步的异结构混沌系统应用到混沌掩盖和混沌参数调制保密通信中。仿真结果表明，异结构混沌系统能够实现稳定的同步，且在混沌掩盖和混沌参数调制保密通信中，有用信号均能有效地在接收端恢复出来。