通过对网上报税安全问题的分析，明确指出随着《电子签名法》的实施，采用PKI机制的网上报税电子数据的法律地位得到解决后，PKI的互操作性问题是影响当前网上报税安全的瓶颈。随后对网上报税应用与多个PKI互操作问题进行详细分析，提出可以采用安全中间件架构（事务传输层）来解决网上报税中PKI互操作问题。