生物进化一般只在两个个体间进行交配，传统的遗传算法也仅在两个染色体之间进行交叉操作。使用在三个以上的染色体进行交叉操作，并设计了多染色体交叉的算子。多染色体交叉算法可显著提高算法局部寻优能力和收敛速度，但由于收敛速度过快容易产生早熟现象。因此，设计了一种带子种群淘汰策略的小生境算法，可避免算法产生早熟现象。通过几种遗传算法的实验结果比较，证明多染色体交叉算法在多峰优化中的效果要优于传统遗传算法。