近几年，关于从医药文献中抽取药物副作用事件的研究得到了广泛的关注。以前的研究多采用先识别疾病和药物实体后判断实体之间关系的流水线模型。提出了一种联合抽取疾病、药物及药物副作用事件的方法。该方法利用结构感知机算法训练模型，并采用多波束搜索算法进行解码。相比于流水线模型，联合抽取方法一方面能够减少错误传播，另一方面能够利用实体识别和关系抽取的交互作用进一步提升整体效果。实验结果表明，联合方法的效果优于流水线方法。另外，提出的方法可以有效地扩展到其他领域的实体关系抽取系统。