系统动力学方法高度抽象，主要用于战略层。流程导向型（离散事件）建模主要用于操作和策略层。基于智能体的建模可应用于任何层面：智能体可以是竞争的公司、消费者、项目、概念、车辆、行人、机器人等。在AnyLogic中，用户可以始终选择其中最有效的建模方法，或将它们结合在一起解决问题。同时AnyLogic完全支持面向对象建模和层次化建模。