自动LM 使用空间自校正的基因-环境关联测试 概括 autoLM确定等位基因频率与环境指标之间的相关性。 它将使用简单的线性回归来确定最强的GEA相关性。 如果包括遗传簇和种群坐标,autoLM将使用空间自相关和种群结构作为随机变量来预测GEA。 输入 有两个主要输入文件和一个可选文件(请参阅示例文件): 每个人群的等位基因频率,不包含标签格式:第一列是人群名称,其后是每个SNP的等位基因频率。 每个人口的环境变量的度量格式:行对应于人口,其顺序与文件1相同。不包括人口名称。 以下各栏是针对每个人口的原始环境措施。 人口坐标,以米为单位(可选),已缩小标签格式:第一列是人口名称,第二列