RDKit Documentation Release 2019.09.1.pdf
开源化学信息学工具包RDKit的手册。RDKit提供各种功能,如不同的化学I/O格式,包括SMILES/SMARTS,结构数据格式(SDF),Thor数据树(TDT),Sybyl线符号(SLN),mol2和蛋白质结构文件(PDB)。子结构搜索;标准SMILES;手性支持;化学转化;化学反应;分子序列化;相似性/多样性选择;二维药效团;三维维药效团;分层子图/片段分析;Bemis和Murcko骨架;逆合成组合分析及分子碎裂(RECAP);多分子最大共同亚结构;功能图;基于形状的相似性;基于RMSD的分子比对;基于形状的对齐;使用Open3-DALIGN算法的无监督分子-分子比对;与PyM
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