对于只有一个Windows的系统，很简单：制作一张包含FDISK程序的启动软盘，用软盘启动机器，然后在命令行执行FDISK/MBR。这个命令重置MBR，使得系统直接启动Windows。但是，如果系统在安装Linux之前有多个Windows，按照这种方式运行FDISK/MBR命令将覆盖Windows多重启动菜单，使得机器只能从默认的主操作系统启动。要清除LILO或GRUB返回以前的Windows启动界面，最快速、可靠的办法是使用Windows的故障恢复控制台。故障恢复控制台可以从WindowsCD访问，也可以安装到系统上。