GSEA富集分析,1、准备三个文件第一行:#1.2,表示版本号,自己准备文件时照抄就行; 第二行:两个数分别表示geneNAME的数量和样本数量(矩阵列数-2); 矩阵:第一列是NAME;第二列Description,没有的话可以全用na或任意字符串填充;后面的就是基因在不同样本中标准化后的表达数据了(部分统计量metricsforrankinggenes计算需要log转换后的数据,后面会有提及。其它情况是否为log转换的数据都可用,GSEA关注的是差异,只要可比即可)。 #其次是样品分组信息(通常用.gmt作为后缀) 第一行:三个数分别表示:34个样品,2个分组,最后一个数字1是固