面对现有概念设计方法创新层次和可操作性时常不能兼顾的困境，合理地将可拓学的冲突解决理论和生物生长中的中心法则引入概念设计过程中，以多层次产品分解粒度作为设计信息表达载体，借助可拓变换的推理机制提出了一种多层次可拓基因推理的概念设计方法，较好地解决了兼顾问题。讨论了设计方法的总体框架和相应原型系统，实例化地验证了方法和系统的可行性。