针对已经存在的集装箱班轮运输企业，研究其在碳税不确定情景下的船队规划问题，以辅助企业作出风险中立决策，避免碳税不确定性可能给企业带来的极端风险。利用二维情景树描述碳税实施时间和税率的未来情景，采用随机规划方法建立考虑此碳税结构的船队规划模型，加入不可预见性约束条件以保证决策步骤与碳税情景结构一致。从行业搜集数据并设计算例，实验结果表明该模型能够求解实际问题，其决策过程能灵活地根据碳税实现情景进行阶段性调整。通过与同样情景下的确定性模型决策结果相比较，发现本随机模型能实现更高的船队营运收益和更低的船队碳排放量。