羽扇豆与结瘤细菌和非结瘤细菌均形成内生缔合。 在这项研究中，使用多基因座序列分析（MLSA）分析与羽扇豆和大豆相关的根瘤细菌之间的系统发育关系。 在分析的17种细菌菌株中，有13种从羽扇豆根瘤中分离出来。 从美国农业部国家根瘤菌种质资源库获得。 另外，检查了分别从天然羽扇豆和国产大豆分离出的两种根瘤细菌菌株。 使用了16S rRNA基因和三个持家基因（atpD，dnaK和glnII）的序列。 所有参考基因仅从现有的完整基因组序列中检索。 单株和串联基因树中的12个菌株的聚类一致，但USDA菌株3044、3048、3504、3715和3060不一致。根据串联系统发育，我们建议USDA 3040、