在现代社会中，有一种不可思议的生物，我们称为精灵。人类与它们和谐相处，并且有许多和口袋妖怪有关的职业，像培育师、训练师等。口袋妖怪们平时可以被缩小收入一个叫做精灵球的球内，被训练师带在身上或放在口袋中，“口袋妖怪”因此得名。它们有着与众不同的能力，人类将精灵驯化，帮助人类战胜一切困难。因此诞生了训练师。训练师为了得到最高的荣耀，会让精灵们进行对战。 游戏中，玩家将扮演一名口袋妖怪训练师，并向着最强训练师的目标进发。玩家在游戏中会经历各式各样的冒险，从高原到雪山再到火山，深入海底寻找远古遗留的宝藏，探寻尚未被人发觉的神秘精灵世界。抓捕世界上最罕见的小精灵，搭配和组合自己的最强的精灵战队。在竞技场