HIV的高度变异性是抗逆转录病毒药物耐药性的驱动力，这代表了医疗保健方面的挑战。 提出的模型代表了对HIV-1基因组中每个基因的变异性的数学分析。 它取决于线性关系，其中自发突变出现的可能性与基因长度与整个基因组长度的比率成正比。 数学分析表明，tat，vpr和vpu是HIV-1基因组中最少的突变基因，蛋白酶PROT基因是聚合酶POL中最少的突变基因成分。 因此，tat，vpr和vpu是HIV-1重组亚单位疫苗的最佳候选，或者是“初次和加强”疫苗组合的一部分。 而且，基于蛋白酶抑制剂的方案代表了HIV克服的高遗传障碍。