在DNA算术运算的理论模型中，普遍应用固定基数制，比如二进制、三进制。但是由于受到进位的影响，难以实现并行运算。基于Adleman-Lipton模型，分析了剩余数制的基本原理，改进了整数的DNA链表示，并将其应用于DNA算术运算，给出了剩余数制下进行DNA算术运算的算法模型。由于在剩余数制中，算术运算（加、减、乘）在剩余位之间无须进行进位计算，故可以降低运算过程的复杂度，而且有利于进行各个剩余位上的并行计算。