通过X射线单晶衍射（CuKα）确定丝裂霉素C的绝对构型，并制备了新的丝裂霉素C的结晶二水合物。 实验结果为丝裂霉素C的真正绝对构型提供了明确的答案，并可能结束数十年来困扰研究人员的争论。 同时，标出了美国药典USP36-NF31，中国药典2015​​年版中有关丝裂霉素C的一些争议性结构和文献数量。 绝对构型也可以通过1D（1H和13C）和2D（HSQC，HMBC，1H-1H COZY和NOESY）NMR间接验证。 丝裂霉素C二水合物的粉末X射线衍射（PXRD）图谱与计算得出的图谱相似，表明样品的纯度极佳。