抗生素诱导的肠道微生物组消融的小鼠模型已用于研究健康和疾病中的微生物组。 通过革兰氏染色，定量流式细胞术，细菌细胞培养，16S核糖体RNA（rRNA）基因V3区域的下一代测序，显微镜观察，广谱抗生素治疗小鼠不同粪便的粪便微生物群分析和tuf基因的序列分析。 不可培养的革兰氏阳性球菌和可培养的酵母菌是在喂食特定饮食的抗生素治疗小鼠的粪便中最容易检测到的微生物，该饮食使用酪蛋白作为蛋白质来源，麦芽糊精10和蔗糖作为碳水化合物来源，而猪油作为主要脂肪来源。 16S rRNA基因可变区的高通量测序和tuf基因测序确定了主要的细菌系统型为乳球菌。 老鼠的食物中充满了不可耕种的乳球菌，它们在食用后支配着肠