尽管事实上氯对人类有极大的毒性，但在全世界的水和废水处理行业中却广泛用作消毒剂。 它的毒性进一步扩展到在杀死微生物和对水中有机物起作用的过程中产生消毒副产物。 更重要的是，最近的研究证明了消毒对抗生素抗性基因（ARG）传播的潜在影响，特别是对城市污水处理厂最终消毒废水中的自由生活性ARG而言。 确实，氯化前的大肠杆菌浓度与最终流出物中大量的细胞外ARG呈强相关。 然而，较低的温度和较高的铵浓度被认为与细胞内ARG有关。 氯化可能会升高大量的ARG，因此，会引发自然界中抗生素耐药性扩散的危险。 因此，越来越多地证明了氯的毒性，这迫切要求停止使用氯来处理水和废水。 至少对于紫外线和紫外线/过氧化氢