FPGA共有四种配置模式:从串模式(Slave Serial($566.8500)),主串模式(MasterSerial($566.8500)),从并模式(Slave Parallel/SelectMap)以及边界扫描模式(Boundary-Scan)。具体的配置模式由模式选择引脚M2、M1、M0决定。不同的配置模式所对应的M2、M1、M0,配置时钟的方向以及相应的数据位宽。