S变换是一种由小波变换及短时傅里叶变换改进后的时频分析工具,由于其良好的自适应分辨率近年来已被用于电力系统故障研究。但由于S变换运算过程存在窗函数之外的冗余运算,计算量较大,影响运算速度。为此提出了一种基于快速S变换的小电流接地方式下的故障选线新算法。利用快速S变换后各线路零序电流在特征频带内的模值进行分析选线。最后通过大量仿真算例证明了此方法能够有效地进行故障选线,正确率高,并且节省了运算时间。