净化空气方法的选择是洁净室设计的首要问题。每个洁净室都要在洁净程度与建造费用中找到平衡。不论最终的设计如何,每个洁净室的建造都有其基本原则。主要是需要有一个封闭的房间,由非污染物建造并能提供洁净的空气,还包括可以防止由外界或操作人员带入的意外污染。