生物信息学:任选一种编程语言设计一个双序列全局比对的程序
任选一种编程语言,设计一个双序列全局比对的程序。要求: 1) 输入两条蛋白质序列,输出比对结果例如: Alignment Score: 12345 E E E E E K K K K K A A A A A F F F E E E E E – – – – – B B B B B F F F 2) 使用BLOSUM62矩阵来对序列中氨基酸符号的match和mismatch打分。 3) 使用动态规划的方法(Needleman-Wunsch算法)。 4) 计算空位(gap)的罚分时,使用仿射空位罚分策略,gap opening的分数为-11,gap extension的分数为-1。 5) 测试程序时
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