针对智能电网建设中通信网络数据安全问题,结合智能电网通信网络特点,提出一种将电网频率信息应用于实时交互数据认证的方法。针对电网实时频率检测网络进行频率水印建模,利用分数阶傅里叶变换在发送的数据中嵌入频率水印,根据嵌入的水印对接收的数据进行安全认证。分数阶傅里叶变换分散了嵌入信息在传统时频域的能量分布,安全性好。仿真与实验结果表明,基于分数阶傅里叶变换的频率水印嵌入算法具有较高的安全性,并对常规的噪声攻击、低通滤波攻击和下采样攻击具有抵抗能力。