metDataModel,基于质谱的代谢组学的数据模型 我们的目标是定义最小的数据模型集,以促进计算代谢组学的互操作性。 该软件包将列出基本概念和数据结构,然后我们可以将它们导入其他项目,并通过继承扩展到更专业的类。 在相关领域中已经进行了广泛的软件开发。 XCMS生态系统( )是数据预处理的主要示例。 Escher项目( )演示了新陈代谢的建模。 科学的发展依赖于实验测量和理论建模的紧密相互作用,两者应该相互促进。 但是,两者之间在代谢组学上存在明显的差距。 例如,Escher中的元素质量表(在1.7.3版中进行了检索)具有平均质量,但质谱仪可测量同位素质量。 许多软件程序已经具有出色