RdPCA:深入了解主成分分析 源码
具有读深度的主成分分析(RdPCA),用于scRNA-seq数据 具有读取深度的主成分分析(RdPCA)是主成分分析(RdPCA)的扩展,可从读取深度提取生物信号以改善scRNA-seq数据分析中的降维效果。 基本用法 fit_pca_linear在功能model.py返回RdPCA坐标。 fit_pca_linear(expr_mat, ndim_lat, cc_mat=None, size_factor=None, batch_mat=None, \tmodel='poisson', device=torch.device('cpu') ) expr_mat
文件列表
RdPCA-main.zip
(预估有个6文件)
RdPCA-main
README.md
891B
src
.gitignore
12B
utils.py
462B
model.py
3KB
struct_pca_loss.py
2KB
struct_funcs.py
3KB
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