play cellranger:使用10x cellranger cmd播放以读取对齐 源码
下载sratoolkit 请按照此下载适用于您的环境的工具。 例如,我为Ubuntu-20.04下载的是sratoolkit.2.10.9-ubuntu64。 下载cellranger 请按照此下载适用于您的环境的工具。 例如,我得到的是cellranger-5.0.1。 要验证您的下载,请运行cellranger testrun :在一个小的测试数据集上执行“计数”管道。 下载实验室数据 对于概念验证测试,请转到此以获取一些样本fastq数据。 下载参考资料 Cell Ranger需要人类参考(GRCh38)或鼠标参考数据集。 对于我们的实验室数据SRR9595741,请在上获取鼠标参
文件列表
play-cellranger-main.zip
(预估有个3文件)
play-cellranger-main
README.md
3KB
example_stdout.txt
82KB
example_web_summary.html
3.4MB
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