LTEE网络分析 源码
自述作者:Rohan Maddamsetti genbank参考文件REL606.8-RM.gbk是使用以下命令手动编辑的 更改:b0092现在是ddlB而不是ddl。 b0381现在是ddlA而不是ddl。 制作LTEE宏基因组学数据集中的突变表。 conda激活ltee-metagenomix cd LTEE-metagenomic-repo python rohan-write-csv.py> ../results/LTEE-metagenome-mutations.csv 要使用conda软件包管理器安装SNAP.py,请运行以下命令: conda安装-c snap-stanfor
文件列表
LTEE-network-analysis-master.zip
(预估有个21文件)
LTEE-network-analysis-master
submit-cong2-jobs.sh
153B
filter-ProteomeVis-for-Ecoli.py
907B
submit-zitnik2-jobs.sh
155B
submit-cong4-jobs.sh
153B
metagenomics-library.R
12KB
metabolic-enzymes.R
13KB
fix-Cooper2003-geneIDs.py
2KB
calc-ppi-network-statistics.py
13KB
thermostability-analysis.R
45KB
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