suite2p:钙成像记录中的细胞检测 源码
Suite2p 用于处理双光子钙成像数据的管道。 版权所有(C)2018 Howard Hughes Medical Institute Janelia Research Campus suite2p包含以下模块: 登记 细胞检测 峰值检测 可视化GUI 该代码由Carsen Stringer和Marius Pachitariu编写。 要获得支持,请打开一个。 参考文件在。 反卷积算法是基于,其设置基于 。 有关GUI演示,请参见此twitter。 您可以找到matlab版本。 请注意,该算法较旧,在非圆形ROI上效果不佳。 有关suite2p的工作原理的演讲,请。 阅读位于的文
文件列表
suite2p:钙成像记录中的细胞检测
(预估有个154文件)
MANIFEST.in
339B
config
630B
.gitignore
95B
build_depgraph_cycles.bat
126B
build_depgraph.bat
112B
.gitignore
11B
profile_pipeline.bat
36B
run_pipeline_tiffs_or_batch.ipynb
6KB
separate_multichannel_expt.ipynb
229KB
view_neuropil_masks.ipynb
10KB
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