婴儿肠道微生物群中分类功能关系的多组学表征 该存储库托管可重现的脚本,用于手稿工作流程中呈现的分析,用于Nguyen等人的手稿“婴儿肠道微生物群中的分类单元功能关系的多组学表征”中表示的分析。 目前正在准备2020年。 脚本被组织成模块化的功能,并被馈送到以drake设计的工作流中。 调用make_.R文件中的make(plan_name)以执行工作流程。 唯一的例外是预测模型和贝叶斯评估,因为它们计算量大,并且在达特茅斯的发现集群中并行运行。 plots_脚本包含所有绘图功能。 analysis_脚本包含所有分析功能。 process_脚本包含处理分析输出的所有功能,