捕捉· 靶标的紧凑聚集,以实现全面杂交 CATCH是一个Python软件包,用于设计探针集以用于捕获各种序列的核酸。 全面覆盖:CATCH接受任何未比对序列的集合,通常是一种或多种微生物物种所有已知遗传多样性的全基因组。 它设计了寡核苷酸序列,可确保覆盖这种多样性,从而可以针对可定制的目标快速设计详尽的探针组。 紧凑的设计:CATCH可以在指定的寡核苷酸数量(例如阵列大小)约束条件下进行设计。 它搜索可能集合许多物种的探针集空间,以找到最佳设计。 这使得它的设计可以随着已知的遗传多样性很好地扩展,并且还支持具有成本效益的应用。 灵活性:CATCH支持的应用范围不限于全基因组富集,例如物种