生物信息学工具:用于生物信息学和基因组学研究的有用算法和脚本的集合 源码
生物信息学工具 为生物信息学和遗传学研究编写的有用算法和脚本的集合。 要求 Python 3.7以上 目录 结盟 为核苷酸和氨基酸序列找到最佳局部或全局比对的程序。 global_align.py 比对两个核苷酸序列的Needleman-Wunsch算法。 用法 global_align.py [fasta] -m [match] -s [mis] -d [indel] 必填参数 fasta:包含用于比对的序列数据的文件,用“>”表示 -m / --match:每次比赛的比对得分 -s / --mismatch:每次不匹配的罚款 -d / --indel:每次插入或删除的惩罚 可选参数
文件列表
bioinformatics-tools-master.zip
(预估有个15文件)
bioinformatics-tools-master
.gitignore
2KB
hidden_markov_model
hmm.py
11KB
rna_seqtools
quality_control.py
3KB
quantify_exp.py
2KB
alignment
local_align.py
6KB
global_align_aa.py
8KB
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