指示 1.安装git。 克隆github仓库: git clone https://github.com/cnsb-boston/Omics_Notebook.git 2 A.本地运行。 一世。 在install.R文件中安装指定版本的R和Python以及所有软件包(请参见下文)。 ii。 运行Notebook.py脚本,它将自动执行整个管道。 python3 Notebook.py 2 B.使用Docker运行。 给定R程序包依赖项的复杂性,在docker的帮助下在本地计算机或云资源上运行可能是最简单的。 一世。 安装Python(3.6),tkinter和Docker。 ii。