umcg_scripts 源码

qqpreserve53896 3 0 ZIP 2021-02-23 03:02:47

umcg_scripts

文件列表

umcg_scripts-master.zip (预估有个68文件)

umcg_scripts-master

.DS_Store 12KB

telomeres

mediation_analysis.R 9KB

write_feather_object.R 915B

apply_permutation_FDR.R 1KB

run_methylation_assoc_v2.R 3KB

NEXT_tables

add_comment_cols.R 820B

process_LLnext_tables.py 15KB

.ipynb_checkpoints

Untitled-checkpoint.ipynb 72B

process_MR_results-checkpoint.ipynb 9KB

Untitled1-checkpoint.ipynb 35KB

plot_BCAA.R 5KB

calculate_Fstatistics_2.R 9KB

mibiogenOct2020

calculate_overall_mafs.py 3KB

mibiogen-GWAS_bidirectional_per_bact.R 3KB

mibiogen-ukbiobank.R 5KB

make_plots.R 5KB

parse_qtls_for_MR.py 1KB

run_MR.R 3KB

run_MR_one_direction.R 4KB

mibiogenSep2019

calculate_overall_mafs.py 3KB

write_failed_filters.py 2KB

filter_MR_results_by_nsnps_samplesize.py 1KB

mibiogen-ukbiobank.R 5KB

mibiogen-GWAS_bidirectional_per_bact.R 3KB

get_rs_by_positions_dbSNP_adriaan_MR.py 2KB

BCAA

run_MR_AA-pqtls.R 2KB

run_MR_AA-pqtls.proxies.R 3KB

run_MR_pqtls-AA.R 1KB

run_MR_AA-pheno-AA.R 3KB

process_MR_result.py 5KB

misc

collapseIntersectBedRes.py 365B

calculate_PRS.sh 1KB

HLA_imputation_pipeline.sh 2KB

gender_differences

run.R 10KB

plot_disease_prevalence.R 7KB

calc_derivatives.r 8KB

plotting_functions.R 13KB

microbiome_test2.R 4KB

selectColumns.R 321B

microbiome__test.R 6KB

diff_postprocessing.R 11KB

merge2tables.R 680B

plot_diseases_histogram_test.R 8KB

get_basic_stats.R 4KB

calc_derivatives.R 8KB

preprocessing_gam_fitting_functions.R 20KB

plot_diseases_histogram.R 4KB

test_prior_grouping.R 9KB

.Rhistory 0B

loess_test.R 5KB

find_correlated_trend_difs.R 9KB

run_gearshift.R 5KB

polynomials_test.R 9KB

anova+gam.R 9KB

correlate_phenotypes.R 2KB

gams_age_bins_diffs.R 7KB

additional_functions.R 5KB

rnaseq_gam_spline_difs.R 12KB

cluster_with_prior_grouping.R 5KB

get_timepoint_difference.R 3KB

plot_densities_gearshift.R 2KB

clustering_functions.R 8KB

run_microbiome_boxy.R 5KB

get_breakpoints.R 3KB

run2.R 7KB

associate_pheno_diseases.R 4KB

fda_test.R 3KB

gam_spline_difs.R 13KB

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