CDKHashFingerPrint:即兴使用的CDK哈希指纹源码

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CDKHashFingerPrint:即兴使用的CDK哈希指纹

文件列表

CDKHashFingerPrint-master.zip (预估有个45文件)

CDKHashFingerPrint-master

blog

FP Cases.png 153KB

Accuracy.jpg 52KB

FPR.xlsx 45KB

Accuracy.png 253KB

TPR_FPR.png 241KB

fingerprinter

nbactions-release-profile.xml 2KB

nbactions.xml 2KB

src

main

java

com

bioinception

chem

fingerprints

feature

NaturalOrderComparator.java 5KB

FeatureGenerator.java 11KB

FeatureFingerprinter.java 13KB

ScaffoldHashedFingerprinter.java 13KB

State.java 4KB

PathEncoder.java 9KB

interfaces

IFingerprinter.java 3KB

IWalker.java 1KB

helper

RandomNumber.java 2KB

BloomFilter.java 9KB

MoleculeWalker.java 7KB

BitSetIterable.java 2KB

hashed

HashedFingerprinter.java 15KB

HashedBloomFingerprinter.java 12KB

cdk

State.java 4KB

Fingerprinter.java 12KB

PathEncoder.java 8KB

benchmark

BenchmarkHashedFingerprint.java 10KB

helper

Base.java 10KB

Data.java 2KB

BenchmarkIsomorphism.java 8KB

test

resources

mol

C00021.mol 2KB

C00137.mol 1KB

C00257.mol 1KB

C00186.mol 583B

C00196.mol 1KB

C00107.mol 1KB

java

com

bioinception

chem

fingerprints

feature

HashedFingerprinterTest.java 11KB

RingSearchTestCases.java 3KB

circle

RingSearchCircularTestCases.java 3KB

CircularFingerprinterTest.java 13KB

HashedBloomFingerprinterTest.java 9KB

hashed

HashedFingerprinterTest.java 12KB

RingSearchTestCases.java 3KB

ScaffoldHashedFingerprinterTest.java 9KB

isomorphism

SubgraphTest.java 5KB

pom.xml 3KB

README 3KB

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