这些脚本演示了在啤酒酵母核Kong复合体(NPC)中Nup133蛋白的建模中使用 , , 和以及。 首先,使用模型器生成由FoXS拟合到SAXS数据的Nup133的初始比较模型。 然后,使用AllosMod对模型进行构象采样,最后使用最小集合搜索来识别四个模型,这些模型一起复制了SAXS数据和一组电子显微镜类平均值。 最终模型还针对未在建模中使用的一组化学交联进行了验证。 脚本的完整描述可以找到。 脚步 比较建模 可以在MODELLER子目录中找到用于生成Nup133各个部分的比较模型的Python脚本。 每个子目录对应于与单个结构一致的建模(目录名称与出版物中补充表S1中的蛋白质ID匹配