reCOGnizer:使用COG数据库进行基于域注释的工具 源码
识别器 使用数据库进行基于域注释的工具。 特征 reCOGnizer是使用RPS-BLAST和CDD数据库作为参考的蛋白质功能识别的用户友好实现。 它构建了数据库的分离版本,使RPS-BLAST可以在多线程中运行该数据库,从而大大提高了蛋白质注释中最耗时的步骤的速度。 将域分配给蛋白质后,reCOGnizer将CDD ID转换为相应DB的ID,并进一步获得CDD上可用的域描述 根据所涉及的数据库检索更多信息: 然后将这些COG整理到蛋白质与COG的关系表中,其中包括来自COG的三个功能分类。 reCOGnizer还将分配的COG功能转换为EC号,从而提供更多功能信息。 安装 要安装reC
文件列表
reCOGnizer-master.zip
(预估有个33文件)
reCOGnizer-master
install.bash
296B
Dockerfile
563B
krona_plot.png
151KB
resources
cog2ec.tsv
132KB
fun.tsv
2KB
recognizer.py
20KB
LICENSE
1KB
README.md
5KB
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