pSONIC:通过共线性识别的倍性感知同构直系同源网络 该存储库是pSONIC计划的公共和官方托管地(Conover等,正在审查中)。 如果您对pSONIC的实现或运行有任何疑问,请在GitHub上提交问题。 pSONIC是用于识别多个物种之间直向同源物的工具,即使涉及多倍性也是如此。 比较基因组学研究的第一步之一是创建所有物种之间直系同源物的综合清单。 已经开发了几种方法来做到这一点,但是它们是针对Orders甚至Phyla上远缘物种的设计和测试的。 随着来自密切相关物种的高质量基因组装配数量的激增,这些设计用于深系统发育鉴定的方法将变得不那么理想,因为保守的基因顺序(连续性)可以用作正畸