预测ECF 源码
预测ECF 作者:Horia Todor [ ] 如何使用此代码 有两个主要函数predict35w和predict10w ,它们具有相同的输入格式: predict35w(sequence, dnamatrix, proteinmatrix, row_weights=NA) sequence是包含ECFσ因子的蛋白序列的载体,其启动子特异性正在被预测。 这应该是与补充表1匹配的路线的摘要。 dnamatrix和proteinmatrix是蛋白质和dna比对的匹配矩阵。 程序包将这些作为惰性数据包括在内。 对于“ predict35w”,它们分别应为motif35和domain4 。
文件列表
predictECF-master.zip
(预估有个12文件)
predictECF-master
predictECF_original_updated
NAMESPACE
96B
R
predict10v2.2_w.r
2KB
loglikelyhood4.R
3KB
predict35v2.1_w.r
1KB
data
minus10.RData
2.7MB
domain4.RData
3.92MB
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